Die HIBB-Zentrale nimmt ihre Aufgaben in den vier Geschäftsbereichen Schulentwicklung/Steuerung und Beratung, Gestaltung von Bildungswegen und Übergängen, Personal und Finanzen sowie Außerschulische Berufsbildung und berufliche Weiterbildung wahr. Zusätzlich gibt es die Stabsstelle Strategisches Controlling, Bürgerschaftsangelegenheiten und Öffentlichkeitsarbeit, welche direkt der Geschäftsführung unterstellt ist. Die Geschäftsführung untersteht der Behördenleitung, ist operativ eigenverantwortlich und dem Kuratorium des HIBB berichtspflichtig.
